İzmir Ekonomi Üniversitesi’nde Organ Nakli Haftası Etkinliği
İzmir Ekonomi Üniversitesi, Medical Point Hastanesi iş birliğiyle Organ Nakli Haftası kapsamında bilgilendirme standı düzenledi. Etkinlikte öğrenciler ve akademisyenler, organ ...
| Dersin Adı |
Klinik Biyoinformatiğin Temelleri
|
|
Kodu
|
Yarıyıl
|
Teori
(saat/hafta) |
Uygulama/Lab
(saat/hafta) |
Yerel Kredi
|
AKTS
|
|
MED 320
|
Güz/Bahar
|
1
|
2
|
2
|
4
|
| Ön-Koşul(lar) |
Yok
|
|||||
| Dersin Dili |
İngilizce
|
|||||
| Dersin Türü |
Seçmeli
|
|||||
| Dersin Düzeyi |
Lisans
|
|||||
| Dersin Veriliş Şekli | - | |||||
| Dersin Öğretim Yöntem ve Teknikleri | - | |||||
| Ulusal Meslek Sınıflandırma Kodu | - | |||||
| Dersin Koordinatörü | ||||||
| Öğretim Eleman(lar)ı | ||||||
| Yardımcı(ları) | - | |||||
| Dersin Amacı | Bu derste, bilgisayar bilimi ve programlaması konusunda hevesli olan tıp öğrencilerinin biyoinformatik hakkında bilgi sahibi olma ve bu alanda pratik yapmaları amaçlanmaktadır. Öğrenciler bilgisayar bilimlerindeki becerilerin, tıp alanındaki konulara nasıl entegre edileceğini uygulamalı olarak gerçekleştireceklerdir. |
| Öğrenme Çıktıları |
Bu dersi başarıyla tamamlayabilen öğrenciler;
|
| Ders Tanımı | Genetik, istatistik ve bilgisayar bilimlerinin birleşiminden oluşan ve çok disiplinli bir alan olarak tanımlanan biyoinformatik, yeni nesil sıralama cihazlarından gelen yüzlerce gigabayt veriden doğru ve kaliteli bilgilerin elde edilmesi için son derece önemlidir. \n\nBiyoinformatiğin klinik alandaki uygulamaları, yeni nesil dizi analizi, genetik ve biyoinformatik veri tabanlarının kullanımı, temel filogenetik analizler ve molekül grafik görüntüleme alanlarında uygulamaya dayalı olarak tasarlanan derste, öğrencilere biyoinformatiğin temelleri, giderek artan verileri uygun şekilde şekillendirip yönetmelerini sağlayacak şekilde açıklanacaktır. |
| Dersin İlişkili Olduğu Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları |
|
|
|
Temel Ders | |
| Uzmanlık/Alan Dersleri | ||
| Destek Dersleri |
X
|
|
| İletişim ve Yönetim Becerileri Dersleri | ||
| Aktarılabilir Beceri Dersleri |
| Hafta | Konular | Ön Hazırlık |
| 1 | Genomik veri bilimine giriş | Choudhuri, S., & Kotewicz, M. (2014). Bioinformatics for beginners. London: Elsevier, chapter 1-2. |
| 2 | Yeni nesil dizi analizi | Choudhuri, S., & Kotewicz, M. (2014). Bioinformatics for beginners. London: Elsevier, chapter 3. |
| 3 | Genetik veritabanları - 1 | Choudhuri, S., & Kotewicz, M. (2014). Bioinformatics for beginners. London: Elsevier, chapter 5. |
| 4 | Genetik veritabanları - 2 | Choudhuri, S., & Kotewicz, M. (2014). Bioinformatics for beginners. London: Elsevier, chapter 5. |
| 5 | UNIX işletim sistemlerinde temel komutlar | William, E. (2019). Linux Command Line, 2nd Edition (pp. 1-37). No Starch Press, Incorporated. |
| 6 | Biyoinformatik uygulamalara giriş | Choudhuri, S., & Kotewicz, M. (2014). Bioinformatics for beginners. London: Elsevier, chapter 4. |
| 7 | Haritalama ve hizalama | Choudhuri, S., & Kotewicz, M. (2014). Bioinformatics for beginners. London: Elsevier, chapter 6. |
| 8 | Ara Sınav | |
| 9 | Ham veri işleme – İnsan genomu | Brown, S. M. (2013). Next-generation DNA sequencing informatics. 1st ed. Cold Spring Harbor, New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, chapter 8. |
| 10 | İşlenmiş veriyi değerlendirme – İnsan genomu | Brown, S. M. (2013). Next-generation DNA sequencing informatics. 1st ed. Cold Spring Harbor, New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, chapter 8. |
| 11 | Metagenomik | Brown, S. M. (2013). Next-generation DNA sequencing informatics. 1st ed. Cold Spring Harbor, New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, chapter 11. |
| 12 | Temel Filogenetik Analiz-1 (Veri Hazırlanması) | The Phylogenetic Handbook: A Practical Approach to Phylogenetic Analysis and Hypothesis Testing, 2nd Edition,2009, Chapters 1,2,3, |
| 13 | Temel Filogenetik Analiz-2 (Genetik uzaklık ve nükleotid substitüsyon modelleri, maksimum olabilirlik yöntemleri) | The Phylogenetic Handbook: A Practical Approach to Phylogenetic Analysis and Hypothesis Testing, 2nd Edition,2009, Chapters 4, 5, 6. |
| 14 | Moleküler Grafik Görüntüleme (RasMol) | |
| 15 | Dersin gözden geçirilmesi | |
| 16 | Final Sınavı |
| Ders Kitabı |
|
| Önerilen Okumalar/Materyaller |
| Yarıyıl Aktiviteleri | Sayı | Katkı Payı % |
| Katılım | ||
| Laboratuvar / Uygulama | ||
| Arazi Çalışması | ||
| Küçük Sınav / Stüdyo Kritiği | ||
| Portfolyo | ||
| Ödev |
1
|
30
|
| Sunum / Jüri Önünde Sunum | ||
| Proje | ||
| Seminer/Çalıştay | ||
| Sözlü Sınav | ||
| Ara Sınav |
1
|
30
|
| Final Sınavı |
1
|
40
|
| Toplam |
| Yarıyıl İçi Çalışmalarının Başarı Notuna Katkısı |
2
|
60
|
| Yarıyıl Sonu Çalışmalarının Başarı Notuna Katkısı |
1
|
40
|
| Toplam |
| Yarıyıl Aktiviteleri | Sayı | Süre (Saat) | İş Yükü |
|---|---|---|---|
| Teorik Ders Saati (Sınav haftası dahildir: 16 x teorik ders saati) |
16
|
1
|
16
|
| Laboratuvar / Uygulama Ders Saati (Sınav haftası dahildir. 16 x uygulama/lab ders saati) |
16
|
2
|
32
|
| Sınıf Dışı Ders Çalışması |
0
|
||
| Arazi Çalışması |
0
|
||
| Küçük Sınav / Stüdyo Kritiği |
0
|
||
| Portfolyo |
0
|
||
| Ödev |
1
|
10
|
10
|
| Sunum / Jüri Önünde Sunum |
0
|
||
| Proje |
0
|
||
| Seminer/Çalıştay |
0
|
||
| Sözlü Sınav |
0
|
||
| Ara Sınavlar |
1
|
20
|
20
|
| Final Sınavı |
1
|
30
|
30
|
| Toplam |
108
|
|
#
|
Program Yeterlilikleri / Çıktıları |
* Katkı Düzeyi
|
|||||
|
1
|
2
|
3
|
4
|
5
|
|||
| 1 |
Hekimlik uygulamalarına yönelik bilgi: Temel ve klinik tıp bilimleri, epidemiyoloji, biyoistatistik, biyomedikal informatik, sosyal ve davranış bilimleri alanında edindiği bilgileri tıbbi sorunların önlenmesi, tanısı, sağaltımı ve yönetimi için kullanır. |
-
|
-
|
X
|
-
|
-
|
|
| 2 |
Mesleksel beceride yetkinlik: Mesleğini uygulama için gerekli temel hekimlik becerilerine ve tutuma sahiptir, sınırlarını bilir, kendi performansını değerlendirerek geliştirmesi gereken yönlerini belirler ve bir plan dahilinde uygular. |
-
|
-
|
-
|
X
|
-
|
|
| 3 |
Hasta yönetimi: Toplumda öncelikli sağlık sorunları başta olmak üzere, sağlığı koruma ve geliştirmeyi önceleyen, hasta-merkezli, bütüncül, güvenli, güvenilir, adil, ve akılcı- kanıta dayalı sağlık hizmeti sunar. Gerektiğinde diğer sağlık çalışanları ve kurumlardan sevk zincirini gözeterek destek ister. |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
|
| 4 |
Hasta ve çalışan güvenliği: Tanı, tedavi ve rehabilitasyon süreçlerinde hastaların ve çalışanların sağlığını ve güvenliğini göz önünde bulundurarak sağlık hizmeti sunar. |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
|
| 5 |
Gezegen sağlığı ve sağlıklı yaşam biçimleri: Gezegenimizin sunduğu kaynakların birey ve toplum sağlığı üzerine olan etkilerini gözeterek mesleksel uygulamalarında değerlendirir. Toplumu bilgilendirerek sağlıklı yaşam biçimlerini yaygınlaştırmayı ve sağlığı olumsuz etkileyen faktörleri gidermeyi görevi sayar. |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
|
| 6 |
Bilgi yönetimi ve Araştırma: Bilimsel araştırmanın ve kanıtların nitelikli ve güvenli sağlık hizmeti sunumundaki yerini ve önemini açıklar. Hizmet verdiği toplumdaki sağlık sorunlarını bilimsel yöntemlerle analiz eder. Araştırma yoluyla ürettiği ve bilişim teknolojilerinden uygun şekilde yararlanarak doğru, güvenilir kaynaklardan eriştiği bilgileri, kanıta dayalı hasta yönetim süreçlerinde kullanır. |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
|
| 7 |
Etik ilkelere bağlılık: Mesleğinin gerektirdiği etik ilkeler ile hak ve yasal sorumluluklar çerçevesinde görev ve yükümlülüklerini, iyi hekimlik uygulamalarını ve deontoloji ilkelerini dikkate alarak yerine getirir. Etik ikilemleri tanır, analiz ederek karar verebilir. |
-
|
-
|
X
|
-
|
-
|
|
| 8 |
Mesleksel erdemler: Toplumun hekimliğe güvenini sarsacak davranışlardan kaçınır. Hastalarına ayrım gözetmeksizin şefkatle ve özenle ve empatiyle yaklaşır, onların gönencini kendi çıkarlarının önünde tutar. Hasta bilgilerinin gizliliğinin korunması ve mahremiyetin korunmasına özen gösterir. |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
|
| 9 |
Sağlık politikaları ve savunuculuk: Sağlık politikalarının bireylerin ve toplumun sağlık göstergelerine etkisini değerlendirir. Sosyal güvenirlik ve yükümlülükler doğrultusunda sağlık hizmetlerinin geliştirilmesini savunur. |
X
|
-
|
-
|
-
|
-
|
|
| 10 |
Sosyal yükümlülük olarak sağlığı koruma ve geliştirme: Toplum sağlığını koruma ve geliştirmeyi sosyal yükümlülük olarak kabul eder ve hizmet sunduğu toplumun öncelikli sağlık sorunlarını belirleyerek çözümler üretir, sağlık eğitimi ve danışmanlık hizmetlerini gerçekleştirir. |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
|
| 11 |
Olağandışı durumlarda sağlık hizmeti sunumunda bireylerin ve toplumun sağlığını koruma ve geliştirmeyi önceler. Klinik hekimlik ve halk sağlığı uygulamalarını bütüncül ve yetkin biçimde gerçekleştirir. |
-
|
X
|
-
|
-
|
-
|
|
| 12 |
Sağlıklı hekim-sağlıklı toplum: Kişisel sağlığına, hijyenine, güvenliğine ve görünüşüne önem verir. Sağlığı korumaya yönelik önlemleri, sağlıklı yaşamın sürdürülmesi için stresle baş etme ve tükenmişliği önlemeye yönelik stratejileri açıklar ve uygular. Uygulamalarıyla meslektaşlarına ve topluma örnek olur. |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
|
| 13 |
Değişim yönetimi ve liderlik: Nitelikli, güvenli ve maliyet etkin sağlık hizmeti sunmaya yönelik değişim gerektiren konuları/süreçleri ve gerekli kaynakları sistematik biçimde tanımlar, bu değişikliklere liderlik edebilecek donanımları kazanır. |
-
|
X
|
-
|
-
|
-
|
|
| 14 |
Ekip çalışması: Birlikte çalıştığı sağlık çalışanları ve diğer meslek gruplarıyla olumlu iletişim kurar, etkin geribildirim alma ve verme davranışları gösterir, destekleyici yaklaşımda bulunur, özlük haklarını, görev ve yükümlülüklerini bilir, zamanında ve gereğince yerine getirir, gerektiğinde farklı ekip rollerini üstlenir. |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
|
| 15 |
İletişim becerileri: Yazılı, sözel ve sözel olmayan iletişimi etkin olarak kullanır. |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
|
| 16 |
Nitelikli ve güvenli sağlık hizmeti için iletişim: Hastalar, yakınları, sağlık çalışanları, diğer meslek grupları, kurum ve kuruluşlar ile hasta güvenliği risklerini en aza indirecek ve sağlık hizmetinin niteliğini arttıracak, hastayı karar verme mekanizmalarına ortak edecek, olası farklılıklarını ve gereksinimlerini gözetecek şekilde açık, anlaşılır ve profesyonel ilkelere uygun iletişim kurar ve gerekli bilgilendirmeyi yapar. |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
|
| 17 |
Yaşam boyu öğrenme: Özdeğerlendirme yaklaşımlarını kullanarak mesleki başarımını sorgular, iyileştirme gerektiren alanları tanımlar, öğrenme gereksinimini belirleyerek ve kendi öğrenme sürecini düzenleyerek mesleki bilgi ve becerisini geliştirir. |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
|
*1 Lowest, 2 Low, 3 Average, 4 High, 5 Highest
İzmir Ekonomi Üniversitesi, Medical Point Hastanesi iş birliğiyle Organ Nakli Haftası kapsamında bilgilendirme standı düzenledi. Etkinlikte öğrenciler ve akademisyenler, organ ...
İzmir Ekonomi Üniversitesi, dünya çapında bir üniversiteye dönüşürken aynı zamanda küresel çapta yetkinliğe sahip başarılı gençler yetiştirir.
Daha Fazlası..İzmir Ekonomi Üniversitesi, nitelikli bilgi ve yetkin teknolojiler üretir.
Daha Fazlası..İzmir Ekonomi Üniversitesi, toplumsal fayda üretmeyi varlık nedeni olarak görür.
Daha Fazlası..